宗教裁判所是罗马教皇为了反对异端，也就是怀疑教皇权威的思想和建立的，最早的通谕出现在1184年，由多明我会和方济各会的修道士组成，直属教皇。修道院里有监狱和刑讯室，但最终的判决由世俗政权执行，因为教会是宣扬仁爱的祥和之处。教会的判决常建议对犯人实行必要的措施，但不要流血，这句话一般意味着火刑。
死在活刑柱上的最知名人物要数法国的民族英雄贞德了，英国人相信她是一个巫婆，宗教法庭也希望她承认自己和魔鬼有交易，经过一年的拷打，她始终不承认自己有罪，结果在卢昂被推上火刑柱。
一个匿名的编年史作者(有人考证他是一名巴黎圣母院的教士，与英军关系密切)记载说：英国人搭起了一个高高的柴堆，让贞德只穿了一件浸过硫的衬衫，绑在木桩上，柴堆烧着后不久，刽子手挑开了木柴，让每个人都能从下面看到她的身体，一个女人所有的并且应该保持的秘密暴露无遗，进行了这样一番展览后，刽子手又在贞德的身旁重新加上燃烧的木柴。英国人之所以这么做，除了对贞德的仇视，也是因为民间有这样的传说：贞洁的女人，性器官是不会在烈火中烧伤的。
另外被火刑烧死的著名人士还有捷克的宗教改革家胡斯、意大利的科学家布鲁诺，迦里略如果不肯宣布放弃他的学说，等待他的也是火刑。罗马教会曾坚持：教会过去没有，现在没有，将来直至永远都不会犯错误，但到二十世纪八十年代终于决定为迦里略平反，这时候，人类早已登上了月球。西班牙同欧洲其他国家不同，它的宗教法庭是由国王领导的，十六世纪初，罗马教皇宣布把西班牙宗教法庭逐出教会，但他们依然在国王的支持下烧人。
天主教徒烧人，新教徒也用火刑对付天主教徒。法国的胡格诺派发明一种办法，把一口锅反扣在犯人肚子上，里面放进老鼠，在锅上点火，烫得要命的老鼠惊惶乱窜，会咬开犯人的皮肤钻进体内。
