挪威政府为末日种子库的建造提供了资金支持，全球农作物多样性信托基金帮助进行管理，同时筹集日常运营所需资金。值得一提的是，将种子存放在这里并不收取费用。全球农作物多样性信托基金的资金主要来自比尔&梅琳达·盖茨基金会等组织以及各国政府。
末日种子库2008年投入使用，一年内便保存了来自爱尔兰、美国、加拿大、瑞士、哥伦比亚、墨西哥和叙利亚的大约40万种种子样本。截至2013年3月，种子样本数量增至77万种。在发生大灾难后，末日种子库存储的种子将帮助受灾国家或地区恢复农业生产。此外，这座种子库也是保护农作物多样性的关键，帮助应对气候变化。
由于气候变化和农民改种新杂交品种等因素，世界上的农作物种类正以惊人的速度减少，建造末日种子库的目的就是尽可能多地挽救种子。这个种子库的储藏室温度保持在零下18摄氏度，存放种子的盒子进行真空密封处理，用以限制氧气透过量和降低代谢活动。
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